赤崁樓乃荷蘭人於西元1652年創建，原稱普羅民遮城(Provintia荷文為永恆之意)，漢人則稱之為「赤崁樓」、「番仔樓」或「紅毛樓」；雖然「赤崁樓」已歷經明、清、日據時期，至今仍大約維持原貌。
赤崁樓從荷蘭人據台時期便是行政中心，西元1661年鄭成功驅逐荷蘭人後，即改普羅民遮城為承天府治。清初台江尚未淤塞前，浪濤可直達赤崁樓下，「赤崁夕照」是當時著名的臺灣八景之一。赤崁樓前有九座清代石龜馱碑，是從他處遷移至此，傳說石龜為龍生九子之一，因好負重而變成龜狀。另外「斷足石馬」的雕像有一傳說是因石馬入夜後會化作妖怪騷擾百姓，所以才被斷足，成為現在的模樣。後來，赤崁樓因民變的破壞及疏於管理而日漸頹圮，而原本荷式建築的主體也加上了中國式的建築，一度上面還祭祀了觀世音菩薩等神明。日據時期，赤崁樓改為陸軍衛戍醫院，也陸續展開修建及整修，光復後，將木製結構改建為鋼筋混凝土結構，並將主要入口改向，而成為今日赤崁樓的模樣。
